蓝藻 Oscillatoriaceae rDNA16S－23S基因间隔区的序列分析及其分类学意义

Plant Diversity ›› 1999, Vol. 21 ›› Issue (01): 1-3.

• 研究论文 •

蓝藻 Oscillatoriaceae rDNA16S－23S基因间隔区的序列分析及其分类学意义

陈月琴,唐绍清,何家完,庄丽,屈良鹄

广州中山大学生命科学学院

出版日期:1999-02-25 发布日期:1999-02-25

Sequence Analyses of rDNA Intergenic Spacer Region from Oscillatoriaceae (Cyanobacteria) and Its Taxonomic Significance

CHEN Yue- Qin, TANG Shao- Qing, HE Jia- Wan, Zhuang Li, QU Liang- Hu

School of life Science, Zhongshan University, Guangzhou 510275

Online:1999-02-25 Published:1999-02-25

摘要/Abstract

摘要： 采用末端终止法对蓝藻类颤藻科Oscillatoria sp. rDNA 16s－23S基因间隔区进行了序列测定，获得了Oscillatoria sp. rDNA基因间隔区427个核苷酸，其中包含1个异亮氨酸tRNA基因(tRNA11e)。并通过计算机联网从国际分子生物学数据弹库中获取颤藻科其它种的rDNA基因间隔区序列，通过比较分析，从分子水平对颤藻科Oscillatoriaceae属间的某些分类学问题进行了讨论，并根据序列中核苷酸差异值探讨了颤藻科属间界定的分子标准。提出了rDNA基因间隔区是良好的分子标记，可用于“赤潮”或“水华”蓝藻专一性核酸分子探针的研制.

关键词: 颤藻科, rDNA间隔区, 序列分析, 分类学意义

Abstract: The sequence of rDNA Intergenic Spacer Region (ISR) was determined for the species Oscillatoria sp.(Cyanobacteria). The spacer sequences was 427bp in lengh exclusive of 16S and 23S rDNA coding regions, containing a Ile tRNA gene. Based on the analyses of the obtained sequences and the sequences from other three representative species of Oscillatoriaceae, and two species of Microcystis , the evolutionary affiliation among the genera of Oscillatoriaceae was discussed. In addition, the results showed that rDNA Intergenic Spacer Region can be served as a criteria for the identification or the classification of Cyanobacteria within the genus or intraspecies, which may be a useful genetic marker at the species or popu-lation level and may be one of the most suitable regions in the rRNA gene cistron for preparing DNA probes specific to Cyanobacteria species because of the high divergence of this region.

Key words: Oscillatoriaceae

陈月琴,唐绍清,何家完,庄丽,屈良鹄. 蓝藻 Oscillatoriaceae rDNA16S－23S基因间隔区的序列分析及其分类学意义[J]. Plant Diversity, 1999, 21(01): 1-3.

CHEN Yue- Qin, TANG Shao- Qing, HE Jia- Wan, Zhuang Li, QU Liang- Hu. Sequence Analyses of rDNA Intergenic Spacer Region from Oscillatoriaceae (Cyanobacteria) and Its Taxonomic Significance[J]. Plant Diversity, 1999, 21(01): 1-3.

[1]	杨晨璇, 陈丽, 王娟, 杨宇明, 李璐. 中国特有属藤山柳属 (猕猴桃科) 的花粉形态及其分类学意义[J]. Plant Diversity, 2014, 36(05): 569-577.
[2]	刘博, 沙伟, 张梅娟, 宋璐, 安洪雪. 毛尖紫萼藓GpUCH基因克隆及表达分析[J]. Plant Diversity, 2014, 36(03): 358-364.
[3]	万山平, 刘培贵. 中国白块菌——攀枝花块菌子囊果内可培养细菌的多样性研究[J]. Plant Diversity, 2014, 36(01): 29-36.
[4]	曹小燕, 曹明, 邓敏. 中国水青冈属（壳斗科）叶结构及分类学意义[J]. Plant Diversity, 2014, 36(01): 1-6.
[5]	王东超1、2, 杨永平1、3, 陈家辉1、3, 李馨4. 28种柳属植物的叶表皮微形态特征及其分类学意义[J]. Plant Diversity, 2012, 34(5): 430-442.
[6]	陈露露1，翟羽佳1，王鹏1，王晖1,2，郝家胜1,2，朱国萍1,2 . 茶树胞质型苹果酸脱氢酶的原核表达及生物信息学分析[J]. Plant Diversity, 2010, 32(01): 32-40.
[7]	蔡华1 , 2 , 马传喜1 , 司红起1 , 乔玉强1 . 小麦黄色素合成途径中Psy 基因的克隆及分子特性小麦黄色素合成途径中Psy 基因的克隆及分子特性[J]. Plant Diversity, 2008, 30(6): 693-698.
[8]	陈家辉1 , 2 , 孙航1 , 杨永平1 . 柳属的叶表皮微形态特征及其分类学意义[J]. Plant Diversity, 2008, 30(01): 38-46.
[9]	孙成仁. 五味子属植物种子形态求真及其分类学意义辨析[J]. Plant Diversity, 2006, 28(04): 383-393.
[10]	颜泽洪, 代寿芬, 刘登才, 魏育明, 郑有良. 应用SDS-PAGE 分析和PCR 鉴定长发带芒草的高分子量谷蛋白亚基[J]. Plant Diversity, 2005, 27(06): 653-656.
[11]	杨英军1 , 2 , 周鹏1 . 番木瓜proteinase omega 基因启动子的克隆及功能初步研究[J]. Plant Diversity, 2005, 27(05): 545-551.
[12]	李丽. 部分国产半夏属植物的微形态特征和同工酶分析及其分类学意义[J]. Plant Diversity, 1999, 21(04): 1-3.
[13]	雷立公；梁汉兴. 胡椒科的花粉形态及其分类学意义[J]. Plant Diversity, 1998, 20(04): 1-3.
[14]	孙航,陈书坤. 绞股蓝属植物种皮微结构特征及其分类学意义[J]. Plant Diversity, 1998, 20(03): 1-3.
[15]	张志耘；温洁. 国产酸浆属（茄科）的叶表皮和种皮特征及其分类学意义[J]. Plant Diversity, 1996, 18(04): 1-3.

蓝藻 Oscillatoriaceae rDNA16S－23S基因间隔区的序列分析及其分类学意义

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