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王国宏,方精云,郭柯,谢宗强,唐志尧,沈泽昊,王仁卿,王襄平,王德利,强胜,于丹,彭少麟,达良俊,刘庆,梁存柱
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Guo-Hong WANG,Jing-Yun FANG,Ke GUO,Zong-Qiang XIE,Zhi-Yao TANG,Ze-Hao SHEN,Ren-Qing WANG,Xiang-Ping WANG,De-Li WANG,Sheng QIANG,Dan YU,Shao-Lin PENG,Liang-Jun DA,Qing LIU,Cun-Zhu LIANG
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1 用于JUICE分析的数据表格(附表5), 由“样方-物种-层号-重要值/盖度值” (附表4)的数据转换而来。在附表5中, 第一个单元格是文件名, 一般使用群系的科学名称或群系优势种的拉丁名, 占一行; 第二行是样方号, 所有样方号只能是数字格式, 如果出现非数字格式的样方号, 要事先进行转换; 第一列是植物的拉丁名(从第三行开始, 下同), 第二列是物种所在的层号, 后续各列是物种在样方中的相对盖度或重要值(0-100)。数据整理好后复制到粘贴板。
2 JUICE软件导入数据路径: File—Import—Table。有7种文件格式可选, 常用“From Spreadsheet file (.csv)”或“From Clipboard as Spreadsheet”, 如果采用后者的导入方式, 则连续点击“Next”, 在盖度数据格式(Cover Values)中选择“Percentage Values”, 然后点击“Finish”。
3 数据导入完成后, 在“Analysis”栏目, 选择Twinspan或其他方法进行聚类分析, 分类结果要根据实际情况进行评估, 以确定出较为合理的分类方案。在调整分类方案过程中, 可使用“Shift+鼠标左键”添加或删除样方间的分割线, 用“Shift+鼠标右键”可以给一个或一组样方选择颜色。如有必要, 可启动聚类分析程序对特定颜色覆盖的样方进行再分类。由于中国植被分类专家系统没有建立起来, 目前只能根据样方资料、环境条件等因子对数量分类的结果进行评估或修正。分类结果表中默认的样方编码是系统自动生成的, 如果需要查看原始输入的样方号, 可在“Head”栏目中选择“Original Number”。
4 分类方案确定后, 点击“Synoptic Table”栏目, 选择“Percentage Frequency”, 可保证数据表中显示频率值; 选择“Fidelity”, 分类数据表中将显示特征值。在“Threshold Values”栏目可以设定相关阈值和对特征值进行Fisher检验的显著性水平(α = 0.05, 0.01, 0.001)。例如, 可设置诊断值25、50分别为低诊断值的特征种和高诊断值的特征种的阈值; 同样地, 可设置频率值60为常见种或恒有种的频率阈值; 可设置盖度值75为筛选单优势种的盖度阈值等。对不同属性的物种, 可在分类表中用不同的颜色显示。阈值设置完成后, 在“Synoptic Table”栏目, 点击“Sort Species in Synoptic Table”, 在出现的提示框中选择“Fidelity Measure ”, 点击“Sort”, 即可显示分类表。
5 计算并输出结果: 点击“Synoptic Table”, 在“Analysis of Columns of Synoptic Table”中, 可以设置相关阈值(如果已经设置, 此处可忽略), 点击“Export”—“Export Clusters 1-n” (n是分类单元的个数, 在程序中将显示具体数字), 将输出每个植被分类单元的特征种、常见种和优势种, 输出的文件名是“EXPORT.RTF”。连续点击“Close”和“Cancel”, 退出对话窗口。
6 数据输出路径: 点击File—Export, 在弹出窗口的第一行, 即显示输出文件“EXPORT.RTF”所在的路径。通过File—Export—Synoptic Table路径, 可输出分类表到带逗号的.csv文件, 此文件可以用Word和Excel进行编辑。 |
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